R / ImageJ: Измерение кратчайшего расстояния между точками и кривыми

У меня есть некоторый опыт работы с R в качестве платформы статистики, но у меня нет опыта в математике на основе изображений. У меня есть серия фотографий (формат tiff, известен пикс / мкм) с дырками и неправильными кривыми. Я хотел бы измерить кратчайшее расстояние между отверстием и ближайшей кривой для этого конкретного отверстия. Я бы хотел сделать это для каждой дыры на фотографии. Отверстия тоже не регулярные, поэтому, возможно, мне нужно будет сообщить программе, что такое отверстия, а что такое кривые (ImageJ имеет точечные и сегментированные линейные функции).

Есть идеи, как это сделать? Какой пакет мне следует использовать в R? Вы бы порекомендовали другую программу для такого рода задач?