Используйте литерал regex [MDN] :
var reg = /\(\s*([0-9.-]+)\s*,\s([0-9.-]+)\s*\)/g;
Вы делаете две ошибки, когда используете RegExp
[MDN] :
/
не должны быть частью выражения Кроме того, модификаторы передаются как второй аргумент функции.
Итак, если вы хотите использовать RegExp
(который вы не используете в этом случае), эквивалент был бы следующим:
var reg = new RegExp("\\(\\s*([0-9.-]+)\\s*,\\s([0-9.-]+)\\s*\\)", "g");
(и теперь я понял, почему регулярные выражения являются более удобными)
Я всегда нахожу его полезно скопировать и пропустить выражение RegExp
в консоли и посмотреть его вывод. Принимая ваше исходное выражение, получаем:
/(s*([0-9.-]+)s*,s([0-9.-]+)s*)/g
, что означает, что выражения пытаются сопоставить /
, s
и g
буквально, а parens ()
по-прежнему рассматриваются как специальные символы .
Обновление: .match()
возвращает массив:
["(25.774252, -80.190262)", "(18.466465, -66.118292)", ... ]
, который, кажется, не очень полезен.
Вы должны использовать .exec()
[MDN] для извлечения чисел:
["(25.774252, -80.190262)", "25.774252", "-80.190262"]
Это нужно вызывать до тех пор, пока все строки не будут обрабатывается.
Пример:
var reg = /\(\s*([0-9.-]+)\s*,\s([0-9.-]+)\s*\)/g;
var result, points = [];
while((result = reg.exec(polygons)) !== null) {
points.push([+result[1], +result[2]]);
}
Это создает массив массивов, а унарный плюс (+
) преобразует строки в числа:
[
[25.774252, -80.190262],
[18.466465, -66.118292],
...
]
Конечно, если вы хотите, чтобы значения как строки, а не как числа, вы можете просто опустить +
.
Редактировать, чтобы объединить положения полос facet_wrap
с размерами свободных панелей facet_grid
(Примечание: я увеличил размеры сегментов, потому что их было действительно трудно увидеть. ..)
# data d was created with set.seed(123)
# generate plot without either facet option
p <- d %>%
arrange(organism_name, desc(protein_length)) %>%
mutate(protein_name = factor(protein_name,
levels = unique(protein_name))) %>%
ggplot(aes(x = 1, xend = protein_length,
y = protein_name, yend = protein_name)) +
geom_segment(color = rgb(0, 0, 0), size = 4) +
geom_segment(aes(x = start, xend = end, y = protein_name,
yend = protein_name, color = as.factor(group)),
size = 3) +
scale_x_continuous(breaks = seq(0,500,100), labels = seq(0,500,100)) +
scale_y_discrete(label = NULL, drop = T) +
scale_color_manual(values = c("firebrick1", "dodgerblue1", "darkgoldenrod1")) +
theme_minimal() +
labs(color = "Group", y = "Proteins", x = "Amino Acid Position") +
theme(axis.title.x = element_text(size = 15, face = "bold", vjust = 0.5),
axis.text.x = element_text(size = 12),
panel.grid.minor.x = element_blank(),
axis.title.y = element_text(size = 15, face = "bold", vjust = 0.5),
panel.grid.major.y = element_blank(),
panel.grid.minor.y = element_blank(),
legend.title = element_text(size = 15, face = "bold"),
legend.text = element_text(size = 12))
# create two versions of the plot using facet_grid / facet_wrap,
# with scales set to "free_y" for both, but also space = "free_y" for facet_grid
# (facet_wrap doesn't have this option)
p.grid <- p + facet_grid(organism_name ~ ., scales = "free_y", space = "free_y")
p.wrap <- p + facet_wrap(~ organism_name, ncol = 1, scales = "free_y")
# convert both into grob objects
gp.grid <- ggplotGrob(p.grid)
gp.wrap <- ggplotGrob(p.wrap)
# apply the panel heights of the facet_grid version to the facet_wrap one
gp.wrap$heights[gp.wrap$layout[grep("panel", gp.wrap$layout$name), "t"]] <-
gp.grid$heights[gp.grid$layout[grep("panel", gp.grid$layout$name), "t"]]
# plot the facet_wrap version
grid::grid.draw(gp.wrap)
Оригинальный ответ
Похоже, вы выглядите для facet_grid
вместо facet_wrap
. Это позволяет изменять разрывы осей и высоты граней, если вы установите scales
и amp; space
- "free_y"
:
d %>%
arrange(organism_name, desc(protein_length)) %>%
mutate(protein_name = factor(protein_name,
levels = unique(protein_name))) %>%
ggplot(aes(x = 1, xend = protein_length,
y = protein_name, yend = protein_name)) +
geom_segment(color = rgb(0, 0, 0), size = 1) +
geom_segment(aes(x = start, xend = end, y = protein_name,
yend = protein_name, color = as.factor(group)),
size = 0.7) +
scale_x_continuous(breaks = seq(0,500,100), labels = seq(0,500,100)) +
scale_y_discrete(label = NULL, drop = T) +
scale_color_manual(values = c("firebrick1", "dodgerblue1", "darkgoldenrod1")) +
facet_grid(organism_name ~ ., drop = T,
scales = "free_y", space = "free_y") +
theme_minimal() +
labs(color = "Group", y = "Proteins", x = "Amino Acid Position") +
theme(axis.title.x = element_text(size = 15, face = "bold", vjust = 0.5),
axis.text.x = element_text(size = 12),
panel.grid.minor.x = element_blank(),
axis.title.y = element_text(size = 15, face = "bold", vjust = 0.5),
panel.grid.major.y = element_blank(),
panel.grid.minor.y = element_blank(),
legend.title = element_text(size = 15, face = "bold"),
legend.text = element_text(size = 12))