Невозможно импортировать изображения DICOM в SPM
Возможно, что есть еще один экземпляр клиента, который все еще работает и прослушивает порт 5000.
-1
задан ahp 13 July 2018 в 12:01
поделиться
1 ответ
Похоже, эта ошибка может возникнуть, если отсутствует файл DICOM ImageOrientationPatient, ImagePositionPatient или PixelSpacing. Без них никакая программа не сможет определить правильную геометрию вашего тома.
См. https://github.com/canlab/spm12/blob/master/spm_dicom_convert.m# L1403 для ошибки кода.
Если у вас есть расширенный файл MR, может потребоваться преобразовать его в серию устаревших МР-изображений (вы можете попробовать MRIConvert или другой инструмент для этого). Я не знаком с SPM, поэтому я не знаю, поддерживается ли Enhanced MR, но, конечно же, будет серия стандартных МР-изображений.
0
ответ дан cneller 17 August 2018 в 12:58
поделиться
-
1спасибо cneller, но я уверен, что в файлах dcm есть три названия, о которых вы упомянули. Проблема восходит к строке 1395, которая выводит функцию read_DimOrg пустым. этой функции требуется поле DimensionIndexSequence. – ahp 14 July 2018 в 02:55
-
2Этот атрибут требуется для Enhanced MR, поэтому, если он отсутствует, источник DICOM технически недействителен ( dicom.innolitics.com/ciods/enhanced-mr-image/… ). Возможно, вы можете использовать инструмент для добавления вручную, или, возможно, есть инструменты, которые могут конвертироваться в серию стандартных МР-изображений, которые более терпимы к отсутствию необходимых атрибутов. – cneller 16 July 2018 в 14:20
Другие вопросы по тегам: