h5py выдает ошибку после установки [дубликат]

На этот вопрос уже есть ответы здесь:

Закрыто 7 лет назад.

Возможный дубликат:
Установка h5py на OS X

Я пытаюсь заставить h5py работать на моем Macbook Pro с OS X Lion 10.7.3. Это работало раньше, но каким-то образом оно было удалено, и я не могу установить его снова. Кажется, это связано с установкой XCode 4.3, но я не уверен.

При импорте h5py я получаю следующую ошибку:

>>> import h5py


   Traceback (most recent call last):

  File "", line 1, in 
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/h5py/__init__.py", line 1, in 
    from h5py import _errors
ImportError: dlopen(/Library/Python/2.7/site-packages/h5py/_errors.so, 2): Symbol not found: _H5E_ALREADYEXISTS_g
  Referenced from: /Library/Python/2.7/site-packages/h5py/_errors.so
  Expected in: flat namespace
 in /Library/Python/2.7/site-packages/h5py/_errors.so

Думаю, это как-то связано с библиотекой HDF5. Он еще не был установлен, поэтому я сначала установил его, используя

brew install hdf5

. Это не дало ошибок. Но следующее предупреждение в конце. что, я думаю, важно:

ld: warning: ignoring file ../hdf5-1.8.8/hdf5/lib/libhdf5.a, 
file was built for archive which is not the architecture being linked (i386)

Я не уверен на 100%, что это значит, но я предполагаю, что эта библиотека скомпилирована для архитектуры i386, однако в этом каталоге больше файлов, на которые она не жалуется:

libhdf5.la
libhdf5.dylib -> libhdf5.7.dylib
libhdf5.7.dylib
libhdf5.settings
libhdf5.a
libhdf5_hl.la
libhdf5_hl.dylib -> libhdf5_hl.7.dylib
libhdf5_hl.a
libhdf5_hl.7.dylib

Позже я также сам скомпилировал исходный код, скачанный с веб-сайта группы HDF5 (http://www.hdfgroup.org/HDF5/). Используя следующую строку конфигурации, чтобы убедиться, что она делает разделяемые библиотеки, я добавил --enable-shared и отключил fortran:

./configure --with-zlib=/usr/local --disable-fortran 
--prefix=/usr/local/ --target=x86_64-apple-darwin 
-build=x86_64-apple-darwin --host=x86_64-apple-darwin 
--enable-shared --disable-production

Я удалил обе библиотеки h5py и hdf5 и переустановил их несколько раз (обе компилируя h5py самостоятельно, поскольку используя pip и easy_install), но это, похоже, не помогло.

Я также установил h5py, используя только что созданную сборку с помощью этой команды:

python setup.py build --hdf5=../hdf5-1.8.8/hdf5

Я также обновил свои установки numpy и scipy до последних версий.

задан Community 23 May 2017 в 12:00

0 ответов

Другие вопросы по тегам:

compilation h5py python hdf5

h5py выдает ошибку после установки [дубликат]

0 ответов

Похожие вопросы: