Git pull удалил незафиксированные изменения

Я только что сделал новый репозиторий на github. Начиная с папки, полной файлов, я сделал следующие шаги::

git init
git add -A
git remote add origin...

#Now pull in the first commit that github made
git pull origin master

#Check everything is OK
ls

Эй! Все мои файлы исчезли! Что случилось? Могу ли я вернуть их?