Автономная установка пакета R и зависимостей

Предположим, мне нужно установить ряд пакетов на машину (Linux), не имеющую подключения к Интернету. Допустим, я загрузил копию cran и записал ее на DVD-диск, который я приношу в автономное место:

wget ftp://cran.r-project.org/pub/R/src/contrib/*.tar.gz

Я даже могу добавить файл PACKAGES, который содержит обзор всех исходных пакетов и их зависимостей:

library(tools)
write_PACKAGES()

Как Могу ли я использовать это в автономном режиме для установки исходного пакета таким образом, чтобы зависимости разрешались и устанавливались также из локальных файлов? Например, кто-то хочет установить пакет ggplot2, который имеет довольно глубокую структуру зависимостей. Предположим, что исходный пакет ggplot2 и все его зависимости доступны как исходные пакеты в текущем рабочем каталоге. Если я это сделаю:

install.packages("ggplot2_0.9.1.tar.gz", repos=NULL)

Это приведет к ошибке, потому что зависимости вообще не разрешены. В качестве альтернативы:

install.packages(list.files(pattern="*.tar.gz"), repos=NULL)

Однако это также игнорирует структуру зависимостей и пытается установить пакеты в алфавитном порядке, что также не удастся.

Я просмотрел available.packagesи contrib.url, но не могу найти пример установки исходного пакета из локального файла, включая его зависимости.

57
задан Jeroen 29 May 2012 в 22:47
поделиться