почему cygwin такой медленный

Я запустил скрипт на Ubuntu и проверил его время:

$ time ./merger
./merger  0.02s user 0.03s system 99% cpu 0.050 total

он потратил менее 1 секунды. но если бы я использовал cygwin:

$ time ./merger
real    3m22.407s
user    0m0.367s
sys     0m0.354s

На это ушло более 3 минут. Почему это случилось? Что мне сделать, чтобы увеличить скорость выполнения на cygwin?