У меня часто есть основной файл R Markdown или файл Knitr LaTeX, в котором я являюсь источником
какого-либо другого файла R (например, для обработка данных). Однако я подумал, что в некоторых случаях было бы полезно, чтобы эти исходные файлы были их собственными воспроизводимыми документами (например, файл R Markdown, который не только включает команды для обработки данных, но также создает воспроизводимый документ, объясняющий обработку данных). решения).
Таким образом, я хотел бы иметь такую команду, как source('myfile.rmd')
в моем основном файле R Markdown. который будет извлекать и получать весь код R внутри фрагментов кода R myfile.rmd
. Конечно, это приводит к ошибке.
Работает следующая команда:
```{r message=FALSE, results='hide'}
knit('myfile.rmd', tangle=TRUE)
source('myfile.R')
```
где results='hide'
можно опустить, если требуется вывод. То есть Knitr выводит R-код из myfile.rmd
в myfile.R
.
Тем не менее, это не кажется совершенным:
source(...)
.Итак, мой вопрос: Есть ли более элегантный способ получения кода R для файла R Markdown?