В аннотации к Amazon Elastic Beanstalk говорится:
Elastic Beanstalk позволяет вам «открыть капот» и сохранить полный контроль… даже передавать переменные среды через консоль Elastic Beanstalk.
http://aws.amazon.com/elasticbeanstalk/
Как передать другие переменные среды, помимо той, что находится в конфигурации Elastic Beanstalk?