Плагин отчета Jenkins JaCoCo не выполняется, если Build failed

Наиболее подходящим вариантом в этом случае является: использование поля экземпляра:

string strHeaderFileName;

protected void multiFileUpload_FileUploaded(object sender, FileUploadedEventArgs e)
{
    // ...
    strHeaderFileName = e.File.FileName;
    // ...
}

protected void btnSave_Click(object sender, EventArgs e)
{
    // can use strHeaderFileName
}