У меня есть скрипт Python3, который записывает свой вывод в стандартный вывод, но он жалуется, когда я передаю этот вывод в голову или хвост. Обратите внимание, что в приведенном ниже образце вывода это вроде как работает, поскольку head
возвращает первые две строки вывода в соответствии с запросом.
>./script.py '../Testdata/*indels.ss' -m 5 | head -2 ~/Databases/Avian_genomes/Sandbox/combined
xread
2999 50
Traceback (most recent call last):
File "./new.py", line 194, in <module>
sys.stdout.write(lineout)
IOError: [Errno 32] Broken pipe
Exception IOError: IOError(32, 'Broken pipe') in <_io.TextIOWrapper name='<stdout>' mode='w' encoding='UTF-8'> ignored
Напротив, у скрипта нет проблем с передачей его вывода в awk, как показано ниже.
>./script.py '../Testdata/*indels.ss' -m 5 | awk 'NR < 3 {print $0}' ~/Databases/Avian_genomes/Sandbox/combined
xread
2999 50
Дайте мне знать, если вам нужен какой-то код из сценария помимо того, что содержится в сообщении об ошибке. Я не уверен, что будет актуально.