Возможно ли иметь репозиторий GitHub с двумя ветками, содержащими разные каталоги на моем локальном компьютере?

У меня есть сайт jekyll, который я хотел бы разместить на GitHub. Поскольку плагины jekyll не поддерживаются на GitHub, я хотел, чтобы моя основная ветка содержала только файлы внутри сайта _и создавала ветку разработки, в которой было бы все остальное.

Возможно ли это? Если да, то как я мог это сделать? Я не лучший с git.

спасибо