У меня есть несколько точек данных (x и y ), которые, кажется, имеют логарифмическую зависимость.
> mydata
x y
1 0 123
2 2 116
3 4 113
4 15 100
5 48 87
6 75 84
7 122 77
> qplot(x, y, data=mydata, geom="line")
Теперь я хотел бы найти базовую функцию, которая соответствует графику и позволяет мне делать выводы о других точках данных (, то есть 3
или 82
).. Я читал о lm
и nls
, но на самом деле ничего не понял.
Сначала я создал функцию, которая, как мне показалось, больше всего походит на сюжет:
f <- function(x, a, b) {
a * exp(b *-x)
}
x <- seq(0:100)
y <- f(seq(0:100), 1,1)
qplot(x,y, geom="line")
После этого я попытался создать подходящую модель, используяnls
:
> fit <- nls(y ~ f(x, a, b), data=mydata, start=list(a=1, b=1))
Error in numericDeriv(form[[3]], names(ind), env) :
Missing value or an Infinity produced when evaluating the model
Может ли кто-нибудь указать мне в правильном направлении, что делать дальше?
Последующие действия
Прочитав ваши комментарии и немного погуглив, я скорректировал начальные параметры для a
, b
и c
, и затем внезапно модель сошлась.
fit <- nls(y~f(x,a,b,c), data=data.frame(mydata), start=list(a=1, b=30, c=-0.3))
x <- seq(0,120)
fitted.data <- data.frame(x=x, y=predict(fit, list(x=x))
ggplot(mydata, aes(x, y)) + geom_point(color="red", alpha=.5) + geom_line(alpha=.5) + geom_line(data=fitted.data)