Поискал в интернете и нашел примеры с установкой только одного поля свойства:

xprop -id "$windowid" -f _NET_WM_STATE 32a -set _NET_WM_STATE _NET_WM_STATE_ABOVE 

но как я могу установить несколько полей? Я пытался:

xprop -id "$windowid" -f _NET_WM_STATE 32a -set _NET_WM_STATE '_NET_WM_STATE_ABOVE, _NET_WM_STATE_SKIP_TASKBAR'

и

xprop -id "$windowid" -f _NET_WM_STATE 32aa -set _NET_WM_STATE _NET_WM_STATE_ABOVE,_NET_WM_STATE_SKIP_TASKBAR

и многие другие варианты без везения. Является ли это возможным ?:)

Ок....

Я написал патч для xprop, чтобы исправить это, и он работает, но не знаю, правильно ли это.
Спасибо @MichałGórny.
(xprop.c,v 1.6)

--- xprop.c 2012-07-31 11:24:01.178117974 +0400
+++ xprop.mod   2012-07-31 11:23:19.434784430 +0400
@@ -1487,11 +1487,20 @@
    break;
       }
       case 'a': {
-   static Atom avalue;
-   avalue = Parse_Atom(value, False);
-   type = XA_ATOM;
-   data = (unsigned char *) &avalue;
-   nelements = 1;
+   static unsigned long data32[MAXELEMENTS];
+    char * value2 = strdup(value);
+    char * tmp = strtok(value2,",");
+    nelements = 0;
+    while( NULL != tmp ){
+      data32[nelements] = Parse_Atom(tmp, False);
+      nelements +=1;
+      if(nelements >= MAXELEMENTS)
+        break;
+      tmp = strtok(NULL,",");
+    }
+    type = XA_ATOM;
+    data = (unsigned char *) data32;
+    free(value2);
    break;
       }
       case 'm':