Есть ли способ указать угловые конфигурации в karma.conf.js в IntelliJ?

Не напрямую, но вы можете создать такую ​​функцию:

if (operate(op1, x, xval) && operate(op2, x, xval)) {
    console.log('yay');
}
function operate(operator, x, y) {
    switch(operator) {
        case '<':
            return x < y;
    }
}