R igraph: объединить два графа с весами их ребер

Вы получаете несколько определений, потому что wat объявляется в области файла и дважды отображается в двух исходных файлах.

Вместо этого сделайте переменную declartion extern и определите ее точно в одном исходном файле.

extern int wat;  // In FileB.h

int wat;   // In FileB.cpp