Запуск докер-контейнера через Python API с определенным ulimit

Ваши команды python и shell не идентичны: в команде shell вы указываете пределы soft, а в python вы указываете пределы hard. Синтаксис для аргумента командного флага --ulimit таков:

<type>=<soft limit>[:<hard limit>]

И в документации объясняется:

Примечание. Если вы не предоставите жесткий предел, мягкий предел будет использоваться для обоих значений. Если ulimits не установлены, они будут унаследованы от ulimits по умолчанию, установленных на демоне.

Чтобы получить идентичное поведение, я бы попытался изменить ваши объявления ulimit python на

docker.types.Ulimit(name='stack', soft=67108864, hard=67108864)]

Это звучит как недостаток документации по python , в которой говорится только что soft и hard являются необязательными аргументами.