Как заставить мою программу на python делать скриншоты быстрее?

Во-первых, вы должны переписать, чтобы не создавать новый класс MSS на каждой итерации, и удалить спящий режим:

import mss

with mss.mss() as sct:
    region = {'top': 0, 'left': 0, 'width': 1920, 'height': 1080}

    for xx in range(600):
        imgname = "C:/Users/yaahy/Desktop/scrnshotoutput/imageforgamehack" + str(xx) + ".png"
        imgg = sct.grab(region)
        img1 = mss.tools.to_png(imgg.rgb, imgg.size, output=imgname)
        # pxls = find_yellow_pixels(imgname)
        # pyautogui.click(pxls[0],pxls[1])

Затем, как предложили комментаторы, вы должны объяснить, чего вы хотите достичь, возможно Вы можете избавиться от создания PNG и работать непосредственно с необработанными данными.