Если мой класс реализует Serializable, должен ли я реализовать его в его подклассах?

Правильный способ решить это с помощью lexer и синтаксического анализатора . Вы можете написать простые версии из них самостоятельно, или эти страницы также имеют ссылки на Java-лексеры и парсеры.

Создание рекурсивного синтаксического анализа является хорошим упражнением.