читать вывод из Java Exec

Он работает для 5.7.8:

mysql> create table t1(updated datetime NOT NULL DEFAULT '0000-00-00 00:00:00');
Query OK, 0 rows affected (0.01 sec)

mysql> show create table t1;
+-------+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
| Table | Create Table                                                                                                            |
+-------+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
| t1    | CREATE TABLE `t1` (
  `updated` datetime NOT NULL DEFAULT '0000-00-00 00:00:00'
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 |
+-------+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
1 row in set (0.00 sec)

mysql> select version();
+-----------+
| version() |
+-----------+
| 5.7.8-rc  |
+-----------+
1 row in set (0.00 sec)

Вы можете создать SQLFiddle для воссоздания вашей проблемы.

http://sqlfiddle.com/

Если он работает для MySQL 5.6 и 5.7.8, но не работает на 5.7.11. Тогда это, вероятно, будет ошибкой регрессии для 5.7.11.