Понимание стека Java

Я бы предложил сначала минимизировать что-то вроде YUI Compressor, а затем преобразовать всю строку и числа в значения HEX, используя что-то вроде http://www.javascriptobfuscator.com/

При этом код будет практически недоступен для понимания, и я думаю, что на этом этапе потребуется больше времени, чтобы Хакер мог повторно ввести ваш код, чем на самом деле, если он переписал с нуля. Переписывание и клонирование - это то, что вы не можете остановить. Ведь мы свободные люди!