Попробуйте этот инструмент Javascript Obfuscator
Я использовал его в своей игре HTML5, и он не только уменьшил его размер с 950 КБ до 150, но и сделал нечитаемые компиляторы и мини-блокировки исходного кода обратимы, я лично не знаю, как отменить это обфускацию.