ошибка git clone: ​​сбой RPC; curl 56 OpenSSL SSL_read: SSL_ERROR_SYSCALL, номер ошибки 10054

Если вы внимательно посмотрите на второй вывод, вы увидите, что используется новое место для библиотек. Возможно, все еще отсутствуют библиотеки, которые являются частью glibc.

Я также считаю, что все библиотеки, используемые вашей программой, должны быть скомпилированы против этой версии glibc. Если у вас есть доступ к исходному коду программы, свежая компиляция представляется лучшим решением.