Начиная с версии 3.8 M6, Eclipse (а именно: JDT) имеет встроенные функции для этого. Он настраивается через путь сборки проекта: Свойства проекта> Путь сборки Java> Компилятор> Источник
[/g3]
Объявлено здесь: Eclipse 3.8 и 4.2 M6 - Новые и примечательные , называемые выборочно игнорируют ошибки / предупреждения из исходных папок. Это также, где снимок экрана. Это новая функция, разработанная на ранее связанном Bug 220928 .