Полностью удалите MariaDB или MySQL из CentOS 7 или RHEL 7

Пока вы не можете нить, у вас есть определенная степень управления процессом в php. Вот два полезных набора:

Функции управления процессом http://www.php.net/manual/en/ref.pcntl.php

Функции POSIX http://www.php.net/manual/en/ref.posix.php

Вы можете разветвить свой процесс с помощью pcntl_fork - вернуть PID ребенок. Затем вы можете использовать posix_kill для использования этого PID.

При этом, если вы убиваете родительский процесс, сигнал должен быть отправлен дочернему процессу, говоря ему, чтобы он умер. Если сам php не распознает это, вы можете зарегистрировать функцию для управления им и выполнить чистый выход с помощью pcntl_signal.