./configure не может найти компилятор C после установки OS X Lion

Вам просто нужно вручную установить нужные разрешения с помощью chmod() :

private function writeFileContent($file, $content){
    $fp = fopen($file, 'w');
    fwrite($fp, $content);
    fclose($fp);

    // Set perms with chmod()
    chmod($file, 0777);
    return true;
}