Для меня работало следующее:
syn region pythonDocstring start=+^\s*[uU]\?[rR]\?"""+ end=+"""+ keepend excludenl contains=pythonEscape,@Spell,pythonDoctest,pythonDocTest2,pythonSpaceError
syn region pythonDocstring start=+^\s*[uU]\?[rR]\?'''+ end=+'''+ keepend excludenl contains=pythonEscape,@Spell,pythonDoctest,pythonDocTest2,pythonSpaceError
Взято из измененного python.vim из здесь .