1
ответ

“смущающе найдите что-либо подобное” программирующий использование Python и PBS на кластере

У меня есть функция (модель нейронной сети), который производит числа. Я хочу протестировать несколько параметров, методов и различных исходных данных (значение сотен выполнений функции) от использования Python PBS на...
вопрос задан: 22 July 2010 10:43
1
ответ

Получение кода выхода от процесса, отправленного с qsub на Механизме Сетки Sun

Я хотел бы отправить задания через qsub на Механизме Сетки Sun (теперь: Механизм Oracle Grid?). Я не хочу использовать - синхронизируют да опция или qrsh, потому что я хочу, чтобы моя программа управления была однопоточной и...
вопрос задан: 22 June 2010 07:37
0
ответов

Ожидание завершения набора заданий qsub

У меня есть пакетный скрипт, который запускает несколько заданий qsub, и я хочу перехватить их, когда они все будут выполнены. Я не хочу использовать опцию -sync, потому что я хочу, чтобы они работали одновременно. ...
вопрос задан: 23 May 2017 12:25
0
ответов

Сценарий SGE: печатать в файл во время выполнения (а не только в конце)?

У меня есть SGE-скрипт для выполнения некоторого кода Python, отправленного в очередь с помощью qsub. В скрипте python у меня есть несколько операторов печати (информирующих меня о ходе выполнения программы). Когда я запускаю ...
вопрос задан: 11 July 2013 19:21
0
ответов

& #39;Неожиданный конец файла& #39; и & #39;ошибка определения функции импорта& #39; ошибка при запуске сценария оболочки с использованием qsub

У меня есть следующий сценарий оболочки:#!/bin/sh компакт-диск /SW/локальные/бен/ экспортировать LD _БИБЛИОТЕКА _ПУТЬ=/sw/local/lib :/usr/local/Trolltech/Qt -4.7.2/lib :$LD _БИБЛИОТЕКА _ПУТЬ./FeatureFinderRaw -in /homes/JG -C1 -18.mzML -out /...
вопрос задан: 8 May 2012 10:21
0
ответов

Прямая передача параметров в сценарий pbs

Есть ли способ напрямую передать параметры в сценарий.pbs перед отправкой задания? Мне нужно перебрать список файлов, обозначенных разными номерами, и применить скрипт для анализа каждого файла....
вопрос задан: 10 April 2012 18:12
0
ответов

Исключить определенные узлы при отправке заданий с помощью qsub / Torque?

Есть ли способ исключить определенные узлы (по имени хоста) при отправке пакетных заданий с помощью qsub? Что-то вроде # это просто псевдокоманда: qsub myscript.sh --exclude computer01
вопрос задан: 13 February 2012 15:41
0
ответов

Как MATLAB обрабатывает изменение файла во время выполнения файла?

Предположим, что вы начинаете запускать сценарий. Что произойдет, если вы измените этот файл во время его выполнения? Кажется, что MATLAB берет копию файла и затем начинает его выполнение. Я хочу сделать ...
вопрос задан: 11 February 2012 20:40
0
ответов

Могу ли я удалить сценарий оболочки после того, как он был отправлен с помощью qsub, не затрагивая задание?

Я хочу отправить несколько заданий с помощью qsub - все задания очень похожи. У меня есть сценарий, в котором есть цикл, и в каждом случае он перезаписывает файл tmpjob.sh, а затем выполняет qsub tmpjob.sh. ...
вопрос задан: 6 February 2012 22:00
0
ответов

как указать файл журнала ошибок и выходной файл в qsub

У меня есть сценарий qsub как ##### --- -submit_job.sh --- ##### #! / bin / sh # $ -N job1 # $ -t 1-100 # $ -cwd SEEDFILE = / home / user1 / data1 SEED = $ (sed -n - e "$ SGE_TASK_ID p" $ SEEDFILE) / ...
вопрос задан: 1 February 2012 15:16
0
ответов

параметр для сценариев оболочки, запускаемых с qsub

как я могу параметризовать сценарий оболочки который выполняется в сетке (запускается с qsub)? У меня есть сценарий оболочки, в котором я использую getopts для чтения параметров. Когда я запускаю (qsub script.sh -r firstparam -s ...
вопрос задан: 16 January 2012 05:35
0
ответов

Передача аргумента в сценариях .sh

У меня есть сценарий оболочки foo.sh, который представляет собой задание qsub с содержимым: #! / Bin / bash -l # $ -S / bin / bash # $ -N $ 2 echo $ 1 Я хочу передать два аргумента. Если я вызову qsub foo.sh ab первым ...
вопрос задан: 9 January 2012 00:34
0
ответов

Создание блока qsub до тех пор, пока задание не будет выполнено?

В настоящее время у меня есть программа драйвера, которая запускает несколько тысяч экземпляров «полезной нагрузки» и выполняет некоторые пост- обработка вывода. В настоящее время драйвер напрямую вызывает программу полезной нагрузки ...
вопрос задан: 12 May 2011 20:47
0
ответов

SGE - QSUB не может отправить задания в режиме -sync

У меня есть сценарий perl, который подготавливает файлы для ввода в двоичную программу и передает выполнение двоичной программы системе очередей SGE версии 6.2u2. Задания отправляются с -sync ...
вопрос задан: 3 February 2011 06:11
0
ответов

как автоматически запустить сценарий bash, когда мои задания qsub завершены на сервере?

Я хотел бы запустить сценарий, когда все задания, которые Я отправил на сервер готово. например, я отправляю ssh-сервер "для i в config *; do qsub ./run 1 $ i; done" И я возвращаю список ...
вопрос задан: 7 October 2010 21:57
0
ответов

как ограничить количество параллельного выполнения заданий PBS

У меня есть кластер с 64 узлами, выполняя PBS Pro. Если я отправляю много сотен заданий, я могу получить 64 выполнения сразу. Здорово, кроме тех случаев, когда все 64 задания, оказывается, почти ввод-вывод, связанный, и читают/...
вопрос задан: 12 January 2010 23:35