JavaFX, как сделать текст жирным шрифтом / подчеркиванием и добавить его в отдельную рамку / квадрат?

Простейшим решением может быть использование GridBagLayout#getConstraints(Component) и просто цикл через все компоненты, пока вы не найдете тот, который соответствует требуемой позиции сетки ...

Component match = null;
GridBagLayout layout = ...
for (Component comp : getComponents()) {
    GridBagConstraints gbc = layout.getConstraints(comp);
    if (gbc.gridx = x && gbc.gridy = y) {
        match = comp;
        break;
    }
}