Я пишу текстовый редактор MASM со Scintilla, но некоторые вещи не выделяются

Вы можете использовать преобразование Schwartzian для чтения и сортировки файлов за один шаг,

my @files = 
  map { $_->[0] }
  sort { $a->[1] <=> $b->[1] }
  map { [ $_, /(\d+)/ ] } ;

или используя менее эффективный и более простой вид,

my @files = sort { ($a =~ /(\d+)/)[0] <=> ($b =~ /(\d+)/)[0] } ;