Куда Вы помещаете код очистки для подклассов NSDocument?

Я думаю, что лучший способ - создать функцию, которая будет обрабатывать строку за строкой:

• прочитать строку и разделить на список через str.split()

• Анализ каждого элемента с помощью RegEx . Например, ^[^:]+:\s* поможет вам получить все, что находится перед «:».

• Храните все обратно в нужном месте (используя, например, pandas Dataframe )