Я использую пакет APE (анализ филогенетики и эволюции) в R, обладающий функциональностью рисования дендрограмма. Я использую следующие команды, чтобы прочитать данные в формате Newikk, и нарисуйте дендрограмму, используя функцию графика:
library("ape")
gcPhylo <-read.tree(file = "gc.tree")
plot(gcPhylo, show.node.label = TRUE)
, поскольку набор данных довольно большой, невозможно увидеть какие-либо детали на более низких уровнях дерева. Я вижу только черные зоны, но не детали. Я могу видеть только несколько уровней сверху, а затем не деталь.
Мне было интересно, есть ли какое-либо масштабирование функции сюжета. Я пытался ограничить область, используя XLIM и YLIM, однако они просто ограничивают область, и не уменьшают масштабирование, чтобы детали были видны. Либо масштабирование, либо сделать детали, видимые без масштабирования, решит мою проблему.
Я также ценю признашь, чтобы знать любой другой пакет, функцию или инструмент, который поможет мне преодолеть проблему.
Спасибо.