Объединение 2 столбцов в 1 столбец много раз в очень большом наборе данных в R

Объединение 2 столбцов в 1 столбец много раз в очень большом наборе данных в R

Неуклюжие решения я продолжаю работать, не будут очень быстрыми, если я могу заставить их работать, и истинный набор данных ~1500 X 45000, таким образом, они должны быть быстрыми. Я определенно в недоумении для 1) в этой точке, хотя имеют некоторый код для 2) и 3).

Вот игрушечный пример структуры данных:

pop = data.frame(status = rbinom(n, 1, .42), sex = rbinom(n, 1, .5),
age = round(rnorm(n, mean=40, 10)), disType = rbinom(n, 1, .2),
rs123=c(1,3,1,3,3,1,1,1,3,1), rs123.1=rep(1, n), rs157=c(2,4,2,2,2,4,4,4,2,2),
rs157.1=c(4,4,4,2,4,4,4,4,2,2),  rs132=c(4,4,4,4,4,4,4,4,2,2),
rs132.1=c(4,4,4,4,4,4,4,4,4,4))

Таким образом существует несколько столбцов основной демографической информации, и затем остальная часть столбцов является biallelic информацией о SNP. Исключая: rs123 является аллелью, 1 из rs123 и rs123.1 является второй аллелью rs123.

1) Я должен объединить все biallelic данные SNP, которые в настоящее время находятся в 2 столбцах в 1 столбец, таким образом, например: rs123 и rs123.1 в один столбец (но в наборе данных):

11
31
11
31
31
11
11
11
31
11

2) Я должен определить наименее частое значение SNP (в вышеупомянутом примере, который это 31).

3) Я должен заменить наименее частое значение SNP 1 и другой (s) с 0.