Подводя итог из сообщения Nabble в ответе DavidM:
attach 'c:\test\b.db3' as toMerge;
BEGIN;
insert into AuditRecords select * from toMerge.AuditRecords;
COMMIT;
detach toMerge;
Повторите при необходимости.
Примечание: добавлено detach toMerge;
согласно комментариям майка.