Странная ошибка иерархической кластеризации в R

Моя программа на R выглядит следующим образом:

hcluster <- function(dmatrix) {
    imatrix <- NULL
    hc <- hclust(dist(dmatrix), method="average")
    for(h in sort(unique(hc$height))) {
        hc.index <- c(h,as.vector(cutree(hc,h=h)))
        imatrix <- cbind(imatrix, hc.index)
    }
    return(imatrix)
}

dmatrix_file = commandArgs(trailingOnly = TRUE)[1]
print(paste('Reading distance matrix from', dmatrix_file))
dmatrix <- as.matrix(read.csv(dmatrix_file,header=FALSE))

imatrix <- hcluster(dmatrix)
imatrix_file = paste("results",dmatrix_file,sep="-")
print(paste('Wrinting results to', imatrix_file))
write.table(imatrix, file=imatrix_file, sep=",", quote=FALSE, row.names=FALSE, col.names=FALSE)
print('done!')

Мой вход представляет собой матрицу расстояний (конечно, симметричную). Когда я запускаю вышеуказанную программу с матрицей расстояний, превышающей тысячи записей (ничего не происходит для нескольких сотен), она выдает мне сообщение об ошибке:

Error in cutree(hc, h = h) : 
  the 'height' component of 'tree' is not sorted
(increasingly); consider applying as.hclust() first
Calls: hcluster -> as.vector -> cutree
Execution halted

Моя машина имеет около 16 ГБ ОЗУ и 4 ЦП, так что это не будет проблемой. ресурсов.

Кто-нибудь, пожалуйста, дайте мне знать, в чем проблема? Спасибо!!