Я рад сказать, что на самом деле это возможно сделать, и вы можете сделать это всего несколькими строками кода ( Я не знаю, так ли легко с другими инструментами ):
from Tkinter import *
import os
root = Tk()
termf = Frame(root, height=400, width=500)
termf.pack(fill=BOTH, expand=YES)
wid = termf.winfo_id()
os.system('xterm -into %d -geometry 40x20 -sb &' % wid)
root.mainloop()
Ранее проблема заключалась в использовании неправильной функции для wid.