Вопрос OP связан с окнами, и я не мог использовать других, не обращаясь к каталогу или даже работающему файлу в Notepad ++, поскольку администратор не работал. Поэтому пришлось пройти этот маршрут:
C:\Program Files (x86)\Git\etc>git config --global core.autocrlf false