В классическом ASP возможно ли создать END sub или функцию?

Ваше регулярное выражение выглядит правильно, но вы splitting вместе с ним вместо matching. Вы хотите что-то вроде этого:

// Untested code
Matcher matcher = Pattern.compile("<%=(.*?)%>").matcher(str);
while (matcher.find()) {
    System.out.println(matcher.group());
}