Чем URL без протокола отличается от простого?

Если вы используете msysgit - они только что выпустили версию, которая позволяет опции конфигурации останавливать git.

Исправлено для https://github.com/msysgit/git/issues/101 в выпуске https://github.com/msysgit/msysgit/releases /tag/Git-1.9.4-preview20140611

Вы можете исправить это, установив

git config --global sendpack.sideband false