0
ответов
Как провести различие между наборами данных HDF5 и группами с h5py?
Я использую пакет Python h5py (версия 2.5.0) для доступа к моим файлам hdf5. Я хочу просмотреть содержимое файла и что-то сделать с каждым набором данных. Используя метод посещения: импортируйте h5py def ...
вопрос задан: 17 December 2015 08:53
0
ответов
Каков самый быстрый способ загрузки данных в Matlab
У меня огромное количество данных (> 800 МБ), для загрузки в которые требуется возраст Matlab в основном потому, что он разделен на крошечные файлы размером менее 20 КБ. Все они находятся в проприетарном формате, который я могу читать, и ...
вопрос задан: 7 November 2015 21:34
0
ответов
Передать файл hdf5 в h5py как двоичный объект / строку?
Как я могу обойти дисковый ввод-вывод в h5py? В настоящее время мне нужно сделать что-то вроде этого :msg = socket.recv ()fp = открыть ("tmp.hdf5", 'wb' )fp.write (сообщение )fp.close ()f = h5py.File ('tmp.hdf5', 'r' )... #изменить...
вопрос задан: 29 May 2015 12:18
0
ответов
Могу ли я обновить часть файла HDF5 с помощью библиотеки Python h5py?
Не могу найти никакой команды на http://docs.h5py.org/en/latest/high/file.html, чтобы сделать это.
вопрос задан: 25 February 2015 09:49
0
ответов
matplotlib -Трехмерная поверхность из прямоугольного массива высот
Я пытаюсь построить некоторые данные HDF в matplotlib. После их импорта с помощью h5py данные сохраняются в виде массива, например :массив ([[151, 176, 178], [121, 137, 130], [120, 125,...
вопрос задан: 19 June 2014 23:05
0
ответов
как экспортировать файл HDF5 в NumPy с помощью H5PY?
У меня есть файл hdf5 с тремя массивами, я хочу извлечь один из массивов с помощью h5py.
вопрос задан: 2 April 2014 14:59
0
ответов
Пример кода HDF5
Используя HDF5DotNet, может ли кто-нибудь указать мне на пример кода, который откроет файл hdf5, извлечет содержимое набора данных и распечатает содержимое на стандартный вывод? Пока у меня есть следующее: ...
вопрос задан: 24 March 2014 05:55
0
ответов
Генерация кода HDF5 C
Мне было интересно, есть ли инструмент, способный создавать код чтения и записи C HDF5 из структуры данных C. Я хотел бы, чтобы этот инструмент анализировал заголовочный файл C и генерировал соответствующий код чтения/записи C HDF5...
вопрос задан: 19 February 2014 19:03
0
ответов
HDF5 занимает больше места, чем CSV?
Рассмотрим следующий пример: Подготовьте данные: импортируйте строку импортируйте случайный импорт панд в виде pd matrix = np.random.random ((100, 3000)) my_cols = [random.choice (string.ascii_uppercase) для x in ...
вопрос задан: 19 May 2013 23:18
0
ответов
MATLAB: Differences between .mat versions
The official documentation states the following: . But I have noticed that there are other important differences besides those stated in the table above. For example, saving a cell array with about ...
вопрос задан: 26 April 2013 01:18
0
ответов
Загрузка строк matlab hdf5 в Python
У меня возникают проблемы с чтением файла hdf5 matlab 7.3 с помощью Python. Я использую h5py 2.0.1. Я могу прочитать все матрицы, которые хранятся в файле, но не могу прочитать список строк. h5py показывает...
вопрос задан: 20 August 2012 14:08
0
ответов
hdf5 / h5py ImportError :libhdf5.so.7
Я работаю над проектом, включающим очереди обмена сетевыми сообщениями (msgpack, zmq,... )в системе RHEL 6.3 (x86 _64 ). Я устанавливал самые последние пакеты glib, gevent, pygobject, pygtk и т. д. в...
вопрос задан: 20 July 2012 15:01
0
ответов
Хранение разреженной матрицы numpy в HDF5 (PyTables)
У меня возникли проблемы с сохранением numpy csr_matrix с PyTables. Я получаю эту ошибку: TypeError: объекты типа ``csr_matrix`` не поддерживаются в этом контексте, извините; поддерживаемые объекты: NumPy ...
вопрос задан: 20 June 2012 12:06
0
ответов
записать boost :: multi_array в набор данных hdf5
Существуют ли какие-либо библиотеки или заголовки для написания векторов C ++ или boost :: multi_arrays в наборы данных HDF5 легко? Я просмотрел примеры HDF5 C ++, и они просто используют синтаксис C ++ для вызова c ...
вопрос задан: 12 February 2012 16:02
0
ответов
Linux для просмотра и редактирования HDF5 [закрыто]
HDFVIEW довольно хорош, но есть ли альтернативы? Было бы здорово иметь возможность изменять такие вещи, как настройки фрагментации / сжатия - hdfview не имеет такой функциональности - без необходимости ...
вопрос задан: 17 January 2012 15:25
0
ответов
Загрузка разреженной матрицы Matlab, сохраненной с помощью -v7.3 (HDF5), в Python и работа с ней
Я новичок в python, поступает из Matlab. У меня есть большая разреженная матрица, сохраненная в формате Matlab v7.3 (HDF5). Пока что я нашел два способа загрузки файла, используя h5py и таблицы. Однако работаю над ...
вопрос задан: 8 December 2011 17:02
0
ответов
HDF5 для Python: интерфейсы высокого и низкого уровня. h5py
Я работал с файлами HDF5 с помощью C и Matlab, оба использовали один и тот же способ чтения и записи в наборы данных: открыть файл с помощью h5f
открыть набор данных с помощью h5d
выбрать пространство с h5s и так далее ... ...
вопрос задан: 11 November 2011 16:02
0
ответов
Разница между файлом HDF5 и файлом PyTables
Есть ли разница между файлами HDF5 и файлами, созданными PyTables? PyTables имеет две функции .isHDFfile () и .isPyTablesFile (), предполагающие, что существует
разница между двумя форматами. ...
вопрос задан: 3 November 2011 22:13
0
ответов
Каковы недостатки использования файлов .Rdata по сравнению с HDF5 или netCDF?
Меня попросили изменить программное обеспечение, которое в настоящее время экспортирует файлы .Rdata, чтобы оно экспортировалось в «независимом от платформы двоичном формате», таком как HDF5 или netCDF. Были названы две причины: файлы Rdata могут ...
вопрос задан: 25 October 2011 14:40
0
ответов
экспорт / импорт в numpy, scipy в форматах SQLite и HDF5
Кажется, существует множество вариантов взаимодействия Python с SQLite (sqlite3, atpy) и HDF5 (h5py, pyTables) - Интересно, есть ли у кого-нибудь опыт использования их вместе с numpy массивами или таблицами данных (...
вопрос задан: 25 October 2011 01:06
0
ответов
Python HDF5 H5Py не может открыть несколько файлов
Я использую 64-битную версию Enthought Python для обработки данных в нескольких файлах HDF5. Я использую h5py версии 1.3.1 (HDF5 1.8.4) в 64-битной Windows. У меня есть объект, который предоставляет ...
вопрос задан: 7 October 2011 19:16
0
ответов
Floating Point Exception with Numpy and PyTables
У меня есть довольно большой HDF5 файл, созданный PyTables, который я пытаюсь прочитать на кластере. При чтении отдельных фрагментов я сталкиваюсь с проблемой NumPy. Давайте рассмотрим пример: ...
вопрос задан: 30 September 2011 23:46
0
ответов
Установка h5py на OS X
Я провел день, пытаясь заставить работать модуль h5py python, но безуспешно. Я установил разделяемые библиотеки HDF5, следуя инструкциям, которые я нашел в Интернете, чтобы исправить это. Но это ...
вопрос задан: 16 September 2011 04:03
0
ответов
Ошибка открытия файла HDF5
Я создал функция открытия файла HDF5, такая как следующая: int OpenHDF5 (string sFileName)
{// Проверяем наличие действительного файла HDF5 if (! H5File :: isHdf5 (sFileName.c_str ())) {// Недействительно ...
вопрос задан: 4 August 2011 03:22
0
ответов
Установка атрибутов в наборах данных с использованием HDF5 C ++ api
I ' m с помощью HDF5 C ++ API в HDF5 1.8.7 и хотел бы использовать экземпляр H5 :: Attribute для установки пары скалярных атрибутов в экземпляре H5 :: DataSet, но не может найти никаких примеров. Он довольно урезан и ...
вопрос задан: 13 May 2011 07:46
0
ответов
Опыт использования h5py для аналитической работы с большими данными на Python?
Я выполняю много статистической работы и использую Python в качестве основного языка. Некоторые из наборов данных, с которыми я работаю, могут занимать 20 ГБ памяти, что заставляет работать с ними с использованием функций в памяти в numpy, ...
вопрос задан: 22 March 2011 19:54
0
ответов
Пакетное получение и обновление PyTables
У меня есть ежедневные данные о запасах в виде файла HDF5, созданного с помощью PyTables. Я хотел бы получить группу строк, обработать ее как массив, а затем записать обратно на диск (обновить строки) с помощью PyTables. Я не мог ...
вопрос задан: 18 February 2011 02:50
0
ответов
Unable to reinstall PyTables for Python 2.7
I am installing Python 2.7 in addition to 2.7. When installing PyTables again for 2.7, I get this error - Found numpy 1.5.1 package installed.
.. ОШИБКА :: Не удалось найти локальную установку HDF5.
Вы ...
вопрос задан: 14 February 2011 13:06
0
ответов
Буферы протокола Google, HDF5, сравнение NumPy (передача данных)
Мне нужна помощь, чтобы принять решение. Мне нужно передать некоторые данные в моем приложении, и мне нужно сделать выбор между этими 3 технологиями.
Я немного прочитал обо всех технологиях (учебные пособия, ...
вопрос задан: 20 December 2010 17:19
0
ответов
Mathematica HDF5 и составные массивы
Есть ли у кого-нибудь обходной путь в Mathematica для чтения составных массивов HDF5? У меня есть простой составной 2D-тип (int / float) в таблице, но в настоящее время он игнорируется. Примером типа HDF5 может быть: ...
вопрос задан: 19 December 2010 18:13